Cyrille Ndayirukiye, né le à Kiganda (Ruanda-Urundi) et mort le à Gitega (Burundi), est un général d'armée burundais, ministre de la Défense nationale (en) de 2000 à 2002.
Étant l'un des principaux militaires impliqués dans la tentative de coup d'État de 2015 au Burundi, il fut en conséquence condamné à l'emprisonnement à perpétuité en .
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